Papirgenvindingsprocessen, mens der anvendes færre kemikalier og forurener mindre end jomfru papir, påvirker stadig miljøet. Ikke alt genbrugspapir er det samme. Meget genbrugspapir indeholder en blanding af jomfru og genanvendt papir for at styrke forringende fibre. Jo højere indhold af genanvendt pulp, desto mindre kemikalier er nødvendige for blegning. Ikke alle genvindingsanlæg bruger de samme processer og kemikalier, og nogle er mere skadelige for miljøet end andre.
overfladeaktive
Forskellige typer af overfladeaktive midler anvendes i de-inkningsprocessen. Nogle er toksiske, mens andre er sukker eller proteinbaserede. Forskere udvikler også mekaniske og enzymbaserede processer til affarvning, der er kemisk fri.
Brintoverilte
Dette er et almindeligt, miljøvenligt blegemiddel, der anvendes som et alternativ til klor.
Natriumhydrosulfit
Dette bruges også almindeligvis til at reducere farverne i genbrugspapirmasse. Det frembringer den relativt godartede biproduktnatriumbisulfit.
Klor
Klorgas og hypochloriter bruges mere almindeligt til at blegge jomfrupapirmasse, men kan også bruges i genbrugspapir. Klor producerer dioxin, et giftigt, kræftfremkaldende kemikalie, der gør vej til luft og vand.
Proces klorfri
PCF eller "Process Chlor Free" er det udtryk, der anvendes til genbrugspapir, der ikke bruger chlor i dets blegeproces.