Etiske konflikter er en uundgåelig del af undercover-arbejde. Officerer er ofte forpligtet til at opbygge venskaber og forhold til mistænkte, som de i sidste ende vil forråde i retssalen. Det konstante behov for at skifte fra en kriminel person til officerens sande identitet kan også briste eller presse familieforhold. Efterladt i egen tid i længere perioder, kan embedsmændene være mere villige til at skære etiske hjørner - især hvis de ser bedre jobmuligheder fremad.
Forrådte Forhold
For undercover officerer betyder bygningssager dannelse af tætte relationer til mistænkte, at de i sidste ende vil forråde. Tidligere forbundsagent Billy Queen, der blev grappet med disse virkeligheder under en toårig undersøgelse af mongolernes motorcykelbande, "The Washington Post", rapporterede i oktober 2005. Dronningen havde ingen illusioner om mongolernes forkærlighed for vold, selv om han ofte kunne lide mange af dem. Stresset med at jonglere disse modstridende følelser tvang til sidst dronningen til at gå på pension fra U.S. Bureau of Alcohol, Tobacco, Firearms and Explosives, udtalte avisen.
Korruption Risici
En af de ældste undercover-konflikter er at efterligne kriminelle uden at krydse linjen. Den filippinske nationalpolitichef Jesus Verzosa udtalte denne begrundelse for at forbyde brugen af ulovlige stoffer under narkotikaundersøgelser. ABS-CBN-netværket rapporterede i februar 2009. Chiefs ordre fulgte rapporter, at 221 af 25.134 politibetjente havde mislykket narkotiketest. En lignende skandale rockede New Yorks sydlige Brooklyn område, hvor fire officerer blev arresteret og seks suspenderet til at belønne informanter med stoffer, "New York Times", der blev angivet i januar 2008.
Identitetsproblemer
Isoleret fra familie og venner kæmper undercover officerer for at afbalancere deres reelle og antage identiteter. Dronningens arbejde mod mongolerne tvang flytningen af sin ex-kone og to sønner, som ikke anede hvad der skete, "Washington Post" bemærkede. Britiske officerer er også blevet anklaget for at handle sex for information. En domstol henviste til disse bekymringer i at overtræde Colin Staggs mordforestilling, "The Guardian" rapporterede i januar 2011. Hæringen fulgte rapporterer, at en undercover politimand initierede et forhold med Stagg for at få en bekendtgørelse.
Mistet integritet
På trods af risici og stress er undercover-arbejde fortsat et attraktivt forslag til detektiver og politibetjente, der søger en langsigtet karriere. At gå undercover i New York City kan sikre en detektivfremme i 18 måneder, i stedet for tre til fem år, siger "New York Times". Sådanne processer kan også opdrætte en hjørneskærende mentalitet, der kan skade et agenturs omdømme. I 2003 blev f.eks. 30 narkotiske officerer overført fra Brooklyn South for angiveligt at have betalt $ 30.000 i overarbejde fra afdelingen, rapporterede "New York Times".